本发明涉及电泳数据处理装置以及电泳数据处理方法的技术。
背景技术:
1、已知有对dna(deoxyribonucleic acid,脱氧核糖核酸)的碱基序列信息进行解析的毛细管阵列电泳装置(以下,称为电泳装置)。在电泳装置中,对dna赋予了多个荧光标记的试样在毛细管的内部电泳。并且,在电泳装置中,在试样进行电泳时,向毛细管的检测区域照射激励光,检测由荧光标记发出的荧光作为信号。试样产生的荧光在波长方向上被分光,通过按每个波长区域将光信号变换为电信号的设备、例如ccd(charge coupleddevice:电荷耦合器件)元件、cmos元件而检测为荧光信号。
2、已知有在取得荧光信号时,通过将元件中的多个受光面(与像素对应)模拟耦合而作为1个像素处理,从而增大或减小每1个像素的受光面积的合并功能。例如,在专利文献1中公开了“一种荧光检测装置400,其具有通过被照射荧光信号405而产生信号电荷的多个受光面,根据在受光面产生的多个信号电荷来取得荧光信号强度,荧光检测装置400通过执行硬件像素合并和软件像素合并中的任意一个来取得所述荧光信号强度,其中,所述硬件像素合并通过一并变换多个信号电荷来取得荧光信号强度,所述软件像素合并通过将信号电荷逐个变换为荧光信号强度并将变换后的荧光信号强度相加来取得荧光信号强度”这样的毛细管阵列电泳装置、荧光检测装置以及荧光信号强度取得方法(参照摘要),合并时所应用的多个合并区域的组合被称为合并模式。
3、现有技术文献
4、专利文献
5、专利文献1:日本特开2015-49179号公报
技术实现思路
1、发明所要解决的课题
2、在电泳装置中,需要同时检测并解析来自多个荧光标记的荧光,如果不抑制荧光灵敏度的偏差,则无法得到满意的解析结果。
3、如果具有专利文献1所记载的合并功能,则能够实现数据取得速度的提高以及s/n比的提高。然而,在谋求s/n比的提高的合并区域的调整中,需要用于防止根据荧光标记的波长特性而产生的荧光灵敏度的偏差的改良。
4、因此,在具有合并功能的情况下,通过对荧光标记的组合应用最优化的合并模式,抑制了荧光灵敏度的偏差。
5、但是,在荧光检测速度的提高、取得像素区域的缩小时,产生即使不具有合并功能也能够取得数据的情况。在这种情况下,由于不具有合并功能本身,因此无法进行通过合并模式的应用而实现的荧光灵敏度偏差的抑制。因此,需要不依赖于合并的荧光灵敏度的偏差抑制方法。
6、鉴于这样的背景而完成了本发明,本发明的课题在于辅助高效的电泳结果的解析。
7、用于解决课题的手段
8、为了解决上述课题,本发明具有:荧光光谱计算部,其基于作为与第一基准试样有关的电泳的结果的第一信号电荷数据来计算荧光光谱数据,其中,所述第一基准试样是用于校正实际样品的数据的试样,所述荧光光谱数据是将与所述第一基准试样所使用的荧光标记的信号电荷值有关的波长光谱标准化后的数据;荧光颜色信号数据计算部,其根据作为与第二基准试样有关的所述电泳的结果的第二信号电荷数据和所述荧光光谱数据,计算作为各个所述荧光标记的信号强度的时间序列信息的第二荧光颜色信号数据,并且,基于作为与所述实际样品有关的所述电泳的结果的第三信号电荷数据和所述荧光光谱数据,计算作为各个所述荧光标记的信号强度的时间序列信息的第三荧光颜色信号数据,其中,所述第二基准试样是用于评价或校正所述实际样品的数据的试样;强度校正系数计算部,其在所述第二荧光颜色信号数据中,以预定的所述荧光标记的信号强度为基准,计算作为各个所述荧光标记与设为所述基准的所述信号强度之比的强度校正系数;颜色信号数据计算部,其通过对所述第三荧光颜色信号数据的所述荧光标记的数据的每一个乘以对应的所述强度校正系数来计算颜色信号数据;以及输出部,其输出所述颜色信号数据。
9、发明效果
10、根据本发明,能够辅助高效的电泳结果的解析。
1.一种电泳数据处理装置,其特征在于,
2.根据权利要求1所述的电泳数据处理装置,其特征在于,
3.根据权利要求1所述的电泳数据处理装置,其特征在于,
4.根据权利要求1所述的电泳数据处理装置,其特征在于,
5.根据权利要求1所述的电泳数据处理装置,其特征在于,
6.根据权利要求1所述的电泳数据处理装置,其特征在于,
7.根据权利要求1所述的电泳数据处理装置,其特征在于,
8.一种电泳数据处理方法,其特征在于,