本申请属于脂质组学,涉及一种脂质速记符的映射方法,特别是涉及一种脂质速记符的映射方法、装置、存储介质及电子设备。
背景技术:
1、脂质组学(lipidomics)是系统研究脂质(lipids)的科学分支,涉及对生物体内脂质分子的全面分析和特性描述。脂质组学旨在利用质谱分析(mass spectrometry, ms)、液相色谱-质谱联用(lc-ms)、气相色谱-质谱联用(gc-ms)、核磁共振波谱(nuclear magneticresonance, nmr)、薄层色谱(thin-layer chromatography, tlc)等分析技术,对血液、组织、细胞等生物样本中的脂质分子进行分析和研究,以获取它们在不同生物过程、疾病状态以及药物反应中的功能和动态变化。近年来,随着分析技术的飞速进步,特别是质谱和液相色谱的发展,脂质组学开始迅速崛起。这些技术的进步使得研究人员能够更精确地识别和量化成千上万种不同的脂质分子,包括磷脂、甘油脂和固醇等。在脂质组学中需要对脂质进行标识,然而,现有脂质标识方法仍然存在一些问题需要改进。
技术实现思路
1、本申请实施例提供一种脂质速记符的映射方法、装置、存储介质及电子设备,用于将脂质速记符映射为标准化id。
2、第一方面,本申请实施例提供一种脂质速记符的映射方法,所述映射方法包括:获取脂质速记符;根据所述脂质速记符获取相应的化学式片段;根据所述脂质速记符中的脂类种类缩写从脂质基本结构数据库中获取相应的基本结构化学式;根据所述化学式片段和所述基本结构化学式获取完整的脂质分子化学式;根据所述脂质分子化学式在脂质数据库中进行查询以获取相应的标准化id。
3、在第一方面的一种实现方式中,所述脂质速记符包括以下信息中的任意一种或多种的组合:脂质种类、支链信息、双键位置、总碳链信息、功能基团、功能基团位置、三键、三键位置、标准速记。
4、在第一方面的一种实现方式中,根据所述脂质速记符获取相应的化学式片段包括:对所述脂质速记符进行分解以获取脂质分子的组成部分;将所述脂质分子的组成部分转换为相应的化学式片段。
5、在第一方面的一种实现方式中,所述映射方法还包括:利用显示器显示所述脂质分子的组成部分,以供用户审核。
6、在第一方面的一种实现方式中,所述映射方法还包括:判断所述标准化id是否属于正确的脂质类别。
7、在第一方面的一种实现方式中,所述映射方法还包括:根据标准脂质数据库构建所述脂质基本结构数据库。
8、在第一方面的一种实现方式中,根据标准脂质数据库构建所述脂质基本结构数据库包括:从所述标准脂质数据库中提取已知脂质分子的信息;根据脂质种类提取出各类脂质的基本结构;根据各类脂质的基本结构构建所述脂质基本结构数据库。
9、第二方面,本申请实施例提供一种脂质速记符的映射装置,所述映射装置包括:速记符获取模块,用于获取脂质速记符;化学式片段获取模块,用于根据所述脂质速记符获取相应的化学式片段;基本结构化学式获取模块,用于根据所述脂质速记符中的脂类种类缩写从脂质基本结构数据库中获取相应的基本结构化学式;脂质分子化学式获取模块,用于根据所述化学式片段和所述基本结构化学式获取完整的脂质分子化学式;数据库查询模块,用于根据所述脂质分子化学式在脂质数据库中进行查询以获取相应的标准化id。
10、第三方面,本申请实施例提供一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,所述计算机程序被处理器执行时实现本申请实施例第一方面中任一项所述脂质速记符的映射方法。
11、第四方面,本申请实施例提供一种电子设备,所述电子设备包括:存储器,存储有一计算机程序;处理器,与所述存储器通信相连,调用所述计算机程序时执行本申请实施例第一方面中任一项所述脂质速记符的映射方法。
12、本申请实施例提供脂质速记符的映射方法,该映射方法能够将脂质速记符映射到统一的标准化id上。通过此种方式能够促进跨科研机构的合作、数据的准确性以及可访问性,对于公共数据库的数据发布和学术研究的共享具有重要意义。
1.一种脂质速记符的映射方法,其特征在于,包括:
2.根据权利要求1所述脂质速记符的映射方法,其特征在于,所述脂质速记符包括以下信息中的任意一种或多种的组合:脂质种类、支链信息、双键位置、总碳链信息、功能基团、功能基团位置、三键、三键位置、标准速记。
3.根据权利要求1所述脂质速记符的映射方法,其特征在于,根据所述脂质速记符获取相应的化学式片段包括:
4.根据权利要求3所述脂质速记符的映射方法,其特征在于,还包括:利用显示器显示所述脂质分子的组成部分,以供用户审核。
5.根据权利要求1所述脂质速记符的映射方法,其特征在于,还包括:判断所述标准化id是否属于正确的脂质类别。
6.根据权利要求1所述脂质速记符的映射方法,其特征在于,还包括:根据标准脂质数据库构建所述脂质基本结构数据库。
7.根据权利要求6所述脂质速记符的映射方法,其特征在于,根据标准脂质数据库构建所述脂质基本结构数据库包括:
8.一种脂质速记符的映射装置,其特征在于,包括:
9.一种计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,其特征在于,所述计算机程序被处理器执行时实现权利要求1至7中任一项所述脂质速记符的映射方法。
10.一种电子设备,其特征在于,所述电子设备包括: