本公开涉及分子诊断和分子生物学,尤其涉及一种鉴别颅内多发病变的mirna生物标志物组合及应用。
背景技术:
1、颅内多发病变是一组在临床上常难以鉴别的疾病,尤其是临床上表现为颅内多发病灶的胶质瘤和中枢神经系统淋巴瘤的鉴别诊断。然而这两种肿瘤的处理方案差异极大,胶质瘤主要通过手术切除并辅以放疗结合替莫唑胺同步化疗,而中枢神经系统淋巴瘤通过手术治疗无效,主要以放疗为主,基于此,术前准确区分颅内多发病变,尤其是中枢神经系统淋巴瘤与胶质瘤,对于患者的治疗与预后极为重要。
2、目前,常用ct和mri技术对二者进行诊断及区分,但难以对二者进行准确鉴别,易出现误诊和漏诊情况。通过手术获得组织样本进行病理诊断是相对准确的鉴别方法,但手术具有费用高、且部分患者在接受了手术治疗和病理检测之后才得到确诊,则使之遭受到不必要的开颅手术创伤,增加治疗风险。而液体活检是一种新型微创诊断技术,具有非侵入性、微创性的特点,更加安全。该技术是基于分析体液样本中的生物标志物来诊断疾病、监测疾病进展和评估疗效的非侵入性技术。
3、近些年研究发现mirna(微小核糖核酸,microrna)在多种肿瘤的发生发展中发挥着重要作用,如胶质瘤中mir-1、mir-21等表达升高,且表达程度与胶质瘤的恶性程度相关、中枢神经系统弥漫大b细胞淋巴瘤中,mir-19、mir-21、mir-92a等表达升高。但多数研究仅基于体液(包括脑脊液),未通过组织样本进行验证。
4、因此,急需筛选出一组可以用于鉴别颅内多发病变的脑脊液mirna生物标志物组合,为临床诊治颅内多发病变提供更有力的帮助。
技术实现思路
1、为了解决上述技术问题,本公开提供了一种鉴别颅内多发病变的mirna生物标志物组合及应用。
2、第一方面,本公开提供了一种鉴别颅内多发病变的mirna生物标志物组合,所述mirna组合包括mir-9-3p、mir-33b-5p、mir-137、mir-138-5p、mir-105-5p、mir-10b-5p、mir-146a-5p、mir-150-3p、mir-150-5p、mir-149-5p。
3、本公开所述的mirna生物标志物组合,可以对颅内多发病变进行初筛,通过微创的诊断方法鉴别颅内多发病变的疾病类型,在尽可能减少患者手术风险的前提下,为临床提供更加全面且综合的病理诊断信息,以预测下一步是进入药物治疗、手术切除、放化疗治疗。
4、作为本公开的一种优选技术方案,所述mirna包括受试者的血液、尿液、粪便、脑脊液、唾液、胸腔或腹盆腔积液中的mirna,优选为受试者的脑脊液mirna。
5、本公开中优选采用液体活检方式获得所述mirna,主要是由于颅内病变发生部位不宜进行手术操作,或病人基础条件差,无法进行手术,但需要明确颅内病变性质,以进一步诊治。
6、本公开所述受试者为经病理组织学确诊为胶质瘤、中枢神经系统淋巴瘤或颅内多发非肿瘤病变的颅内多发病变患者。
7、作为本公开的一种优选技术方案,所述颅内多发病变包括胶质瘤、中枢神经系统淋巴瘤或颅内多发非肿瘤病变。
8、第二方面,本公开提供了一种检测第一方面所述的mirna生物标志物组合的物质在制备用于早期鉴别颅内多发病变的产品中的应用。
9、作为本公开的一种优选技术方案,所述产品包括基于高通量测序方法和/或定量pcr方法检测所述mirna生物标志物的表达水平的试剂。
10、作为本公开的一种优选技术方案,所述早期鉴别颅内多发病变包括如下a)和b)中任意一种或多种:
11、a)鉴别或辅助鉴别颅内多发病变细胞;
12、b)鉴别或辅助鉴别颅内多发病变类型。
13、作为本公开的一种优选技术方案,所述颅内多发病变的类型包括胶质瘤、中枢神经系统淋巴瘤或颅内多发非肿瘤病变。
14、作为本公开的一种优选技术方案,所述颅内多发病变的类型的判定方法为:确定来自受试者的脑脊液样品中所述mirna生物标志物的存在或表达水平,以及将所述mirna生物标志物的表达水平与参照进行比较。
15、本公开通过组织样本对脑脊液中检测出的差异mirna进行验证,选出一组与组织样本差异表达一致的mirna,使得检测结果的准确性得到显著提高。
16、作为本公开的一种优选技术方案,所述判定方法具体为:将所述受试者的所述mirna生物标志物的表达水平与参照进行比较:
17、当mir-105-5p表达上调时,受试者的颅内多发病变类型为胶质瘤;
18、当mir-10b-5p表达上调时,受试者的颅内多发病变类型为胶质瘤;
19、当mir-9-3p表达上调时,受试者的颅内多发病变类型为胶质瘤;
20、当mir-146a-5p表达下调时,受试者的颅内多发病变类型为胶质瘤;
21、当mir-150-3p表达下调时,受试者的颅内多发病变类型为胶质瘤;
22、当mir-150-5p表达下调时,受试者的颅内多发病变类型为胶质瘤;
23、当mir-33b-5p表达下调时,受试者的颅内多发病变类型为胶质瘤;
24、当mir-137表达下调时,受试者的颅内多发病变类型为淋巴瘤;
25、当mir-138-5p表达下调时,受试者的颅内多发病变类型为淋巴瘤;
26、当mir-149-5p表达下调时,受试者的颅内多发病变类型为淋巴瘤。
27、本公开所述的表达上调指所述受试者的mirna的表达量水平与参照样品相比,样品中这样的指标的水平升高,所述的表达下调指所述受试者的mirna的表达量水平与参照样品相比,样品中这样的指标的水平降低,由此,所述mirna表达水平升高或降低指示颅内多发病变的进展或阶段。特别地,所述mirna表达水平升高或降低程度指示颅内多发病变的风险升高或恶化程度。
28、作为本公开的一种优选技术方案,所述产品包括芯片、阵列或试剂盒。
29、本公开实施例提供的技术方案与现有技术相比具有如下优点:
30、(1)本公开提供的一种鉴别颅内多发病变的mirna生物标志物组合,经过组织验证,可以对颅内多发病变的类型进行初筛,在尽可能减少患者手术风险的前提下,为临床提供更加全面且综合的病理诊断信息。
31、(2)检测该mirna生物标志物的物质可用于制备期鉴别颅内多发病变的产品,无需开颅,采用脑脊液液体活检技术,并具有非侵入性、微创性、安全性更高。
1.一种鉴别颅内多发病变的mirna生物标志物组合,其特征在于,所述组合包括mir-9-3p、mir-33b-5p、mir-137、mir-138-5p、mir-105-5p、mir-10b-5p、mir-146a-5p、mir-150-3p、mir-150-5p、mir-149-5p。
2.根据权利要求1所述的mirna生物标志物组合,其特征在于,所述mirna包括受试者的血液、尿液、粪便、脑脊液、唾液、胸腔或腹盆腔积液中的mirna。
3.根据权利要求1所述的mirna生物标志物组合,其特征在于,所述颅内多发病变的类型包括胶质瘤、中枢神经系统淋巴瘤或颅内多发非肿瘤病变。
4.检测权利要求1-3任一项所述的mirna生物标志物组合的物质在制备用于早期鉴别颅内多发病变的产品中的应用。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,所述产品包括基于高通量测序方法和/或定量pcr方法检测所述mirna生物标志物的表达水平的试剂。
6.根据权利要求4或5所述的应用,其特征在于,所述早期鉴别颅内多发病变包括如下a)和b)中任意一种或多种:
7.根据权利要求4或5所述的应用,其特征在于,所述颅内多发病变的类型包括胶质瘤、中枢神经系统淋巴瘤或颅内多发非肿瘤病变。
8.根据权利要求7所述的应用,其特征在于,所述颅内多发病变的类型的判定方法为:确定来自受试者的脑脊液样品中所述mirna生物标志物的存在或表达水平,以及将所述mirna生物标志物的表达水平与参照进行比较。
9.根据权利要求8所述的应用,其特征在于,所述判定方法为:将所述mirna生物标志物的表达水平与参照进行比较:
10.根据权利要求4-9任一项所述的应用,其特征在于,所述产品包括芯片、阵列或试剂盒。