本发明属于水产动物分子标记辅助育种领域,具体涉及分子标记23w4及其用于筛选具有高wssv抗性的凡纳滨对虾群体中的应用。
背景技术:
1、凡纳滨对虾( penaeus vannamei),又称南美白对虾,原产于南美太平洋沿岸海域。由于其生长速度快,环境适应性强,自1988年引入我国后,得到大规模推广养殖,是我国水产养殖的支柱产业。生长性状是凡纳滨对虾最受关注的经济性状,然而,随着凡纳滨对虾养殖规模的不断扩大以及养殖环境的恶化,养殖过程中疾病频发,其中白斑综合征病毒(white spot syndrome virus, wssv)传播能力强,感染病毒的对虾摄食量减少,肝胰腺肿大,身体出现白色斑点,3-13天内死亡率可达100%,给对虾产业造成了巨大的经济损失。目前还没有防控病毒传播的有效方法,培育具有wssv抗性的新品种是市场的迫切需求。
2、截止2023年,我国先后培育出12个凡纳滨对虾国审新品种,11个品种的优良性状涉及了生长,仅有“中兴1号”这一品种展现出了对wssv病毒的抗性。生长与wssv抗性之间的遗传相关在不同凡纳滨对虾育种群体中在中度负相关到低度正相关之间,说明不同育种群体中,生长与wssv抗性有不完全一样的平衡机制。
3、单核苷酸多态性标记(snp) 具有丰富度高、密度大、稳定性强、共显性等特点,成为目前虾、蟹等经济甲壳动物中应用最广泛的分子标记技术。目前,凡纳滨对虾wssv抗性相关snp标记较少,开发在不同生长性能群体中均与wssv抗性显著关联的分子标记对充分利用现有优质种源、精准培育wssv抗性新品种具有重要意义。
技术实现思路
1、针对上述现有技术中存在的技术问题,本发明的目的是提供了一种分子标记23w4及其用于筛选具有高wssv抗性的凡纳滨对虾群体中的应用。所述分子标记23w4能够用于凡纳滨对虾高白斑综合征病毒抗性的筛选中,具有很高的鉴定效率及准确率。
2、为解决上述技术问题,本发明拟采用的技术方案是:
3、本发明提供了一种凡纳滨对虾高wssv抗性的分子标记23w4,其特征在于,所述分子标记23w4的核苷酸序列如seq id no.1所示。
4、进一步的,所述分子标记23w4的第301位碱基为c或a碱基突变。
5、进一步的,所述分子标记23w4的第301位点基因型aa为wssv抗性基因型。
6、进一步的,所述引物包括核苷酸序列如seq id no.2和seq id no.3所示的扩增引物以及核苷酸序列如seq id no.4所示的延伸引物。
7、本发明提供了所述的分子标记23w4或所述的分子标记23w4的引物在用于筛选具有高wssv抗性的凡纳滨对虾群体中的应用。
8、进一步的,筛选具有高wssv抗性的凡纳滨对虾群体的具体步骤为:提取凡纳滨对虾群体内待测试样品的dna,并将其作为模板,利用扩增引物和延伸引物进行飞行质谱分型,分型结果中如果第301位碱基基因型为aa,则选择该凡纳滨对虾群体作为培育凡纳滨对虾高wssv抗性的亲本。
9、进一步的,所述凡纳滨对虾群体内待测试样品的数量在30尾以上。
10、进一步的,在飞行质谱分型中,pcr扩增的条件为预变性94℃ 3 min;变性94℃30s,退火56℃ 25s,延伸72℃ 30s,共重复40个循环;最后延伸72℃ 3min;4℃保存。
11、进一步的,在飞行质谱分型中,延伸反应的条件为预变性94°c 30 s;变性94°c5s,退火56°c 5s,延伸80°c 5s,共重复40个循环;最后延伸72°c 3min;4°c保存。
12、本发明提供了所述的分子标记23w4在凡纳滨对虾遗传多样性分析、种质鉴定和遗传图谱构建中的应用。
13、与现有技术相比,本发明具有的优点和有益效果是:
14、1、本发明提供的凡纳滨对虾高wssv抗性分子标记23w4可以不受生长性能的限制,在不同生长性能的育种群体中筛选wssv高抗个体,快速选育出高wssv抗性的亲本群体,促进凡纳滨对虾高wssv抗性新品种的选育进程。
15、2、利用本发明提供的分子标记23w4检测凡纳滨对虾高wssv抗性,方法准确可靠、操作简单,能够有效、快速的筛选出高wssv抗性群体,增加凡纳滨对虾现有种质的利用率,提高苗种产量,对凡纳滨对虾的健康养殖与发展具有重要的意义,具有广阔的应用前景。
1.一种分子标记23w4,其特征在于,所述分子标记23w4的核苷酸序列如seq id no.1所示。
2.根据权利要求1所述的分子标记23w4,其特征在于,所述分子标记23w4的第301位碱基为c或a碱基突变。
3.根据权利要求2所述的分子标记23w4,其特征在于,所述分子标记23w4的第301位点基因型aa为wssv抗性基因型。
4.权利要求1所述的分子标记23w4的引物,其特征在于,所述引物包括核苷酸序列如seq id no.2和seq id no.3所示的扩增引物以及核苷酸序列如seq id no.4所示的延伸引物。
5.权利要求1所述的分子标记23w4或权利要求4所述的分子标记23w4的引物用于筛选具有高wssv抗性的凡纳滨对虾群体中的应用。
6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于,筛选具有高wssv抗性的凡纳滨对虾群体的具体步骤为:提取凡纳滨对虾群体内待测试样品的dna,并将其作为模板,利用扩增引物和延伸引物进行飞行质谱分型,分型结果中如果第301位碱基基因型为aa,则选择该凡纳滨对虾群体作为培育凡纳滨对虾高wssv抗性的亲本。
7.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,所述凡纳滨对虾群体内待测试样品的数量在30尾以上。
8.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,在飞行质谱分型中,pcr扩增的条件为预变性94℃ 3 min;变性94℃ 30s,退火56℃ 25s,延伸72℃ 30s,共重复40个循环;最后延伸72℃ 3min;4℃保存。
9.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,在飞行质谱分型中,延伸反应的条件为预变性94°c 30 s;变性94°c 5s,退火56°c 5s,延伸80°c 5s,共重复40个循环;最后延伸72°c3min;4°c保存。
10.权利要求1所述的分子标记23w4在凡纳滨对虾遗传多样性分析、种质鉴定和遗传图谱构建中的应用。