本发明涉及雷州黑鸭的分子育种,更具体地,涉及一种评估雷州黑鸭开产日龄和/或开产体重的方法。
背景技术:
1、雷州黑鸭是主要位于广东省粤西地区雷州半岛的一个独一无二的优秀地方品种,其属于肉蛋兼用型黑羽鸭,具有体格小、肉质鲜美、产蛋量高、蛋形大、耐粗饲等特性,这些独特的种质特征使其成为优秀的地方品种,受到当地群众的喜爱。正常饲养下,雷州黑鸭的开产日龄为90~120日龄,高峰产蛋率可达到90%以上。可是,由于有关雷州黑鸭的基础研究,当前仍缺乏系统选育及专门化品系培育,所以限制了这一优秀的地方品种在全国范围的推广,因此尚需进行雷州黑鸭生长发育、繁殖性能、种质特性等基础性研究,为保护这一优秀的地方品种奠定基础。
2、n-脱乙酰/n-磺基转移酶(n-deacetylase-n-sulfotransferase,ndst),是肝素(heparin,hep)及硫酸乙酰肝素(heparan sulfate,hs)生物合成的关键酶类,在脊椎动物中共发现有四种ndst亚型。目前对于肝素的了解更多的是作为一种抗凝药物,在临床上广泛使用。n-脱乙酰/n-磺基转移酶-2
3、(n-deacetylase-n-sulfotransferase-2,ndst2),则作为hep生物合成中催化n-乙酰氨基葡萄糖的n-脱乙酰和n-硫酸化两个关键反应进行的重要生物合成酶,ndst2基因突变,将导致肥大细胞不能产生成熟的正常硫酸化肝素。有研究报道,ndst2可能参与胚胎发生早期的hs合成,从而影响胚胎发育。但目前并没有ndst2与禽类产蛋性状相关的报道。
技术实现思路
1、本发明的目的是为了克服现有技术的不足,提供一种评估雷州黑鸭开产日龄和/或开产体重的方法。
2、本发明的第一个目的是提供一种评估雷州黑鸭产蛋性能的方法。
3、本发明的第二个目的是提供一种评估雷州黑鸭产蛋性能的试剂。
4、本发明的第三个目的是提供一种评估雷州黑鸭产蛋性能的试剂盒。
5、本发明的第四个目的是提供任一所述的试剂在建立评估雷州黑鸭产蛋性能的方法中的应用。
6、本发明的第五个目的是提供任一所述试剂在建立评估雷州黑鸭产蛋性能的试剂盒中的应用。
7、本发明的第六个目的是提供任一所述的方法、任一所述的试剂和/或所述的试剂盒在雷州黑鸭杂交后代鉴定或在雷州黑鸭产蛋性能分子育种中的应用。
8、为了实现上述目的,本发明是通过以下技术方案予以实现的:
9、本发明要求保护一种评估雷州黑鸭产蛋性能的方法,检测i11-39 t>c位点的基因型,i11-39 t>c位点位于nc_051777.1:15923464,即zju1.0版鸭基因组的第6染色体的第15923464位核苷酸,存在tt、tc和cc三种基因型。
10、优选地,i11-39 t>c位点基因型为tc型或cc型的个体的开产日龄显著低于i11-39t>c位点基因型为tt型的个体的开产日龄。
11、优选地,i11-39 t>c位点基因型为tc型或cc型的个体的开产体重显著高于i11-39t>c位点基因型为tt型的个体的开产体重。
12、优选地,使用核苷酸如seq id no:1~2所述的引物进行检测。
13、作为一个具体的实施例,扩增总体积为24μl:其中taq pcr mix 10μl,上、下游引物各为0.7μl,ddh2o 10.1μl,dna模板1μl;pcr扩增程序:95℃预变性3min,95℃变性30s后60℃退火45s,72℃延伸1min,一共35个循环;72℃再延伸5min。
14、以及,一种评估雷州黑鸭产蛋性能的试剂,用于检测i11-39 t>c位点的基因型,i11-39 t>c位点位于nc_051777.1:15923464,即zju1.0版鸭基因组的第6染色体的第15923464位核苷酸,存在tt、tc和cc三种基因型。
15、优选地,i11-39 t>c位点基因型为tc型或cc型的个体的开产日龄显著低于i11-39t>c位点基因型为tt型的个体的开产日龄。
16、优选地,i11-39 t>c位点基因型为tc型或cc型的个体的开产体重显著高于i11-39t>c位点基因型为tt型的个体的开产体重。
17、优选地,所述试剂为核苷酸如seq id no:1~2所述的引物。
18、本发明还要求保护一种评估雷州黑鸭产蛋性能的试剂盒,含有所述的试剂。
19、作为一个具体的实施例,含有taq pcr mix、ddh2o、seq id no:1~2所述的引物。
20、本发明还要求保护以下应用
21、任一所述的试剂在建立评估雷州黑鸭产蛋性能的方法中的应用,所述产蛋性能为开产日龄和/或开产体重。
22、任一所述试剂在建立评估雷州黑鸭产蛋性能的试剂盒中的应用,其特征在于,所述产蛋性能为开产日龄和/或开产体重。
23、任一所述的方法、任一所述的试剂和/或所述的试剂盒在雷州黑鸭杂交后代产蛋性状的鉴定或在雷州黑鸭产蛋性能分子育种中的应用。
24、与现有技术相比,本发明具有如下有益效果:
25、本发明发现雷州黑鸭ndst2基因i11-39 t>c位点的基因型与产蛋性能相关的,i11-39 t>c位点基因型为tc型或cc型的个体的开产日龄显著低于i11-39t>c位点基因型为tt型的个体的开产日龄;i11-39 t>c位点基因型为tc型或cc型的个体的开产体重显著高于i11-39 t>c位点基因型为tt型的个体的开产体重。基于此snp位点,可以进行雷州黑鸭杂交后代产蛋性状的鉴定或在雷州黑鸭产蛋性能的分子育种。
1.一种评估雷州黑鸭产蛋性能的方法,其特征在于,检测i11-39 t>c位点的基因型,i11-39 t>c位点位于nc_051777.1:15923464,即zju1.0版鸭基因组的第6染色体的第15923464位核苷酸,存在tt、tc和cc三种基因型。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,i11-39 t>c位点基因型为tc型或cc型的个体的开产日龄显著低于i11-39 t>c位点基因型为tt型的个体的开产日龄。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,i11-39 t>c位点基因型为tc型或cc型的个体的开产体重显著高于i11-39 t>c位点基因型为tt型的个体的开产体重。
4.一种评估雷州黑鸭产蛋性能的试剂,其特征在于,用于检测i11-39 t>c位点的基因型,i11-39 t>c位点位于nc_051777.1:15923464,即zju1.0版鸭基因组的第6染色体的第15923464位核苷酸,存在tt、tc和cc三种基因型。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,i11-39 t>c位点基因型为tc型或cc型的个体的开产日龄显著低于i11-39 t>c位点基因型为tt型的个体的开产日龄。
6.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,i11-39 t>c位点基因型为tc型或cc型的个体的开产体重显著高于i11-39 t>c位点基因型为tt型的个体的开产体重。
7.一种评估雷州黑鸭产蛋性能的试剂盒,其特征在于,含有权利要求2所述的试剂。
8.权利要求4到6任一所述的试剂在建立评估雷州黑鸭产蛋性能的方法中的应用,其特征在于,所述产蛋性能为开产日龄和/或开产体重。
9.权利要求4到6任一所述试剂在建立评估雷州黑鸭产蛋性能的试剂盒中的应用,其特征在于,所述产蛋性能为开产日龄和/或开产体重。
10.权利要求1到3任一所述的方法、权利要求4到6任一所述的试剂和/或权利要求7所述的试剂盒在雷州黑鸭杂交后代产蛋性状的鉴定或在雷州黑鸭产蛋性能分子育种中的应用。