本发明涉及分子生物学，尤其涉及绵羊snp分子标记及其在多角性状检测中的应用。
背景技术：
1、分子育种，即分子标记辅助选择育种，是指利用dna分子标记对育种材料进行选择，综合改良畜禽重要经济性状，是传统遗传育种与现代分子生物学有机结合的育种方法。随着分子生物学的快速发展，分子标记在家畜育种中的应用日益广泛，其重要性也日益凸现。
2、同源框d1（homeobox d1， hoxd1）是一种蛋白质编码基因。该基因是 antp 同源框家族的成员，编码具有同源框 dna 结合域的蛋白质。这种核蛋白作为序列特异性转录因子发挥作用，参与分化和肢体发育。 hoxd基因簇是hox基因家族的一部分，位于2号染色体上，由 hoxd1、 hoxd3、 hoxd4、 hoxd8、 hoxd9、 hoxd10、 hoxd11、 hoxd12 和 hoxd13 的转录因子组成，对肢体和骨骼发育缺陷、神经功能障碍、泌尿生殖系统和心血管系统等常见疾病的发生和组织器官发育至关重要。 hoxd1相关的疾病包括先天性糖基化障碍和3m综合征1型。 hoxd1基因在绵羊上的研究较少，目前未确定 hoxd1基因与绵羊多角性状相关。
3、角是洞角科动物（牛、绵羊、山羊等）的标志性特征，是其演化最成功的器官之一，多角是家养绵羊品种中存在的古老而珍稀的表型。多角绵羊即头上存在2只以上角的绵羊，我国多角绵羊品种主要包括：阿勒泰羊、蒙古羊和藏绵羊等，是珍贵的绵羊遗传资源。由于其具有较高的观赏价值和科学研究价值，近些年来，多角绵羊品种培育越来越受到重视。绵羊角的表型要到其生长至半岁至1岁才会确定。因此，开发与绵羊多角性状相关的snp分子标记及应用，成为本领域亟需解决的技术难题。
技术实现思路
1、基于此，本发明开发了一种与绵羊多角性状相关的snp分子标记，其为绵羊第2号染色体的第132749153bp处存在g/c突变；所述snp分子标记所在的绵羊基因组版本号为oar_v4.0。
2、优选地，所述绵羊为中国的多角绵羊。
3、更优选地，所述绵羊为阿勒泰羊、蒙古羊或藏绵羊。
4、优选地，所述snp分子标记由seq id no.1和seq id no.2所示的引物扩增获得。所述snp分子标记位于扩增产物片段的第200 bp 处。
5、seq id no.1：5’-acgttggatgtgacgctcggattcccaaag-3’；
6、seq id no.2：5’-acgttggatgctggcggtaaccttggagt-3’。
7、进一步，本发明提供了用于扩增所述snp分子标记的引物。
8、优选地，所述引物如seq id no.1和seq id no.2所示。
9、进一步，本发明提供了含有所述引物的试剂或试剂盒。
10、优选地，所述试剂或试剂盒中还包括dntps、taq dna 聚合酶、mg2+、pcr反应缓冲液、标准阳性模板中的至少一种。
11、进一步，本发明提供了所述的snp分子标记、所述的引物、或所述的试剂或试剂盒在以下至少一方面中的应用：
12、（1）检测绵羊个体多角表型；
13、（2）绵羊多角表型的早期预测；
14、（3）多角绵羊的分子标记辅助育种；
15、（4）制备产品；所述产品为试剂、试剂盒或基因芯片。
16、在具体实施过程中，所述的引物还可以与其他用于绵羊表型检测的特异性引物相结合用于绵羊分类和育种研究，也属于本发明的保护范围。
17、当所述snp分子标记的多态性位点的基因型为cc或cg时，绵羊角型为多角；基因型为gg时，绵羊角型为两角。
18、进一步，本发明提供了一种绵羊角型的检测方法，包括：以待测绵羊的基因组dna为模板，采用所述的引物进行pcr扩增。
19、优选地，检测pcr扩增产物片段第200 bp 处的标记，当所述标记处的基因型为cc或cg时，绵羊角型为多角；基因型为gg时，绵羊角型为两角。
20、在具体实施过程中，对于检测pcr扩增产物片段的方法没有特别的限制，可以利用本领域常规的检测方法进行，包括但不限于通过基因测序方法进行检测。
21、优选地，pcr扩增的反应条件为：95℃预变性2分钟；95℃变性20秒，56℃退火30秒，72℃延伸60秒，共45个循环；最后一次循环后延伸3分钟。
22、优选地，pcr扩增的反应体系以5μl计，包括：水 1.75μl，10×pcr buffer 0.625μl，mgcl2(25mm ) 0.325μl，dntp mix (25mm ) 0.1μl，hotstar taq (5u/μl) 0.2μl，引物(0.5μm )1μl，模板dna 1μl。
23、与现有技术相比，本发明的有益效果在于：
24、本发明的snp分子标记可以对绵羊进行基因分型，并对该snp分子标记与绵羊多角表型进行关联，该位点的检出，既为分子育种提供了新的素材，又为绵羊多角性状的标记辅助选择提供了科学依据。
25、本发明提供的分子遗传标记不受绵羊的年龄、性别等限制，可以对待测绵羊进行早期筛选，有效缓解实际生产中优良多角种羊选择时间长的问题，减低育种花费，提高经济效益，将在多角绵羊育种工作中发挥巨大作用。
26、本发明的鉴定方法操作简单、费用不高、准确度高，可实现自动化检测，因而具有很高的育种实践应用价值。本发明可以使有角绵羊个体中鉴定的准确性达98.9%，从而获得可观的经济效益。
1.一种与绵羊多角性状相关的snp分子标记，其特征在于，其为绵羊第2号染色体的第132749153bp处存在g/c突变；所述snp分子标记所在的绵羊基因组版本号为oar_v4.0。
2.根据权利要求1所述的snp分子标记，其特征在于，所述snp分子标记由seq id no.1和seq id no.2所示的引物扩增获得。
3.用于扩增权利要求1或权利要求2所述snp分子标记的引物。
4.根据权利要求3所述的引物，其特征在于，所述引物如seq id no.1和seq id no.2所示。
5.一种试剂或试剂盒，其特征在于，其中含有权利要求3或权利要求4所述的引物。
6.权利要求1或权利要求2所述的snp分子标记、权利要求3或权利要求4所述的引物、或权利要求5所述的试剂或试剂盒在以下至少一方面中的应用：
7.根据权利要求6所述的应用，其特征在于，当所述snp分子标记的多态性位点的基因型为cc或cg时，绵羊角型为多角；基因型为gg时，绵羊角型为两角。
8.一种绵羊角型的检测方法，其特征在于，包括：以待测绵羊的基因组dna为模板，采用权利要求3或4所述的引物进行pcr扩增。
9.根据权利要求8所述的检测方法，其特征在于，检测pcr扩增产物片段第200bp 处的标记，当所述标记处的基因型为cc或cg时，绵羊角型为多角；基因型为gg时，绵羊角型为两角。
10.根据权利要求8或9所述的检测方法，其特征在于，pcr扩增的反应条件为：95℃预变性2分钟；95℃变性20秒，56℃退火30秒，72℃延伸60秒，共45个循环；最后一次循环后延伸3分钟。
