一种用于检测牛羊肠道小RNA病毒的引物对及其应用的制作方法

    专利查询2025-12-04  2


    本发明涉及动物病毒学及分子生物学,尤其涉及一种用于检测牛羊肠道小rna病毒的引物对及其应用。


    背景技术:

    1、小rna病毒(picornavirus)即小核糖核苷酸病毒,为无囊膜、呈二十面体结构的单股正链rna病毒,属于小rna病毒科。许多小rna病毒是重要的人类和动物病原体,可引起中枢神经系统、呼吸道和胃肠道、心脏、肝脏的疾病。截至2022年3月,该科共有158种,分68个属,涵盖80多个物种。随着新一代测序技术的广泛应用,小rna病毒家族不断扩大,牛羊肠道小rna病毒(boosepivirus,boov)是2020年提出的小rna病毒科的一个新属(https://www.picornaviridae.com/ensavirinae/boosepivirus/boosepivirus.htm),被认为是一种潜在的腹泻病原体,并且可以跨种传播,但其致病性和发病机制有待进一步研究。

    2、病毒的检测方法包括体外细胞培养、组织免疫荧光、中和试验、elisa、pcr/rt-pcr等。牛羊肠道小rna病毒是首次通过高通量测序技术在腹泻犊牛粪便样本中发现的。目前,在国内外尚未建立起有效的牛羊肠道小rna病毒体外细胞培养模型和相关的快速检测方法,如组织免疫荧光、中和试验、elisa和pcr/rt-pcr等。

    3、因此,亟需开发一种高效、便捷的检测牛羊肠道小rna病毒的方法。


    技术实现思路

    1、本发明的目的在于提供一种用于检测牛羊肠道小rna病毒的引物对,还提供了非诊断目的的检测牛羊肠道小rna病毒的方法,该检测方法特异性强、灵敏度高、稳定性好,在时间成本、工作量等方面具有明显的优势,从核酸提取到琼脂糖凝胶电泳进行结果分析判定,可在3h内完成,耗时少、且成本低廉,解决了牛羊肠道小rna病毒无法分离鉴定的问题。

    2、为了实现上述发明目的,本发明提供以下技术方案:

    3、本发明提供了一种用于检测牛羊肠道小rna病毒的引物对,所述引物对包括上游引物和下游引物;

    4、所述上游引物的序列如seq id no:1所示;

    5、所述下游引物的序列如seq id no:2所示。

    6、本发明还提供了所述的引物对在制备检测牛羊肠道小rna病毒的试剂盒中的应用。

    7、本发明还提供了一种检测牛羊肠道小rna病毒的试剂盒,所述试剂盒包括所述的引物对。

    8、本发明还提供了一种非诊断目的的检测牛羊肠道小rna病毒的方法,包括如下步骤:

    9、(1)将待测样本的rna反转录为cdna;

    10、(2)以cdna为模板,采用所述的引物对进行pcr扩增,得到扩增产物;

    11、(3)使用琼脂糖凝胶电泳法检测扩增产物的扩增情况,判断是否扩增到牛羊肠道小rna病毒核酸片段。

    12、作为优选,所述pcr扩增的反应体系为:8~12μl 2×es taqmastermix,0.5~1.5μl上游引物,0.5~1.5μl下游引物,1~3μl模板,2~10μl rnase-free water。

    13、作为优选,所述上游引物的浓度为5~15μmol/l;所述下游引物的浓度为5~15μmol/l。

    14、作为优选,所述pcr扩增的反应条件为:92~96℃预变性3~7min;92~96℃变性20~40s,58~62℃退火20~40s,70~74℃延伸20~40s,共32~36个循环;70~74℃延伸8~12min。

    15、作为优选,若扩增到316bp的条带,则待测样本中含有牛羊肠道小rna病毒;若未扩增到316bp的条带,则待测样本中不含有牛羊肠道小rna病毒。

    16、本发明的有益效果:

    17、本发明提供了一种用于检测牛羊肠道小rna病毒的引物对,使用该引物对检测牛羊肠道小rna病毒,具有以下优势:

    18、1)特异性强

    19、本发明的检测方法可以检测出牛羊肠道小rna病毒,所检测的牛冠状病毒、牛肠道病毒、牛病毒性腹泻病毒、牛副流感病毒3型、牛库布病毒、牛轮状病毒、牛星状病毒、大肠杆菌和水对照均无阳性结果;

    20、2)灵敏度高

    21、本发明的检测方法灵敏度高,最小检测限为4.85×10-7ng/μl;

    22、3)耗时少、成本低廉

    23、目前,在国内外尚未建立起有效的牛羊肠道小rna病毒体外培养模型和相关快速检测方法,本发明的检测方法,在时间成本、工作量等方面具有明显的优势,从核酸提取到琼脂糖凝胶电泳进行结果分析判定,可在3h内完成,耗时少、且成本低廉,解决了牛羊肠道小rna病毒无法分离鉴定的问题;

    24、4)稳定性好

    25、重复性试验结果表明本发明的检测方法重复性好。



    技术特征:

    1.一种用于检测牛羊肠道小rna病毒的引物对,其特征在于,所述引物对包括上游引物和下游引物;

    2.权利要求1所述的引物对在制备检测牛羊肠道小rna病毒的试剂盒中的应用。

    3.一种检测牛羊肠道小rna病毒的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1所述的引物对。

    4.一种非诊断目的的检测牛羊肠道小rna病毒的方法,其特征在于,包括如下步骤:

    5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,所述pcr扩增的反应体系为:8~12μl 2×es taq mastermix,0.5~1.5μl上游引物,0.5~1.5μl下游引物,1~3μl模板,2~10μlrnase-free water。

    6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述上游引物的浓度为5~15μmol/l;所述下游引物的浓度为5~15μmol/l。

    7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述pcr扩增的反应条件为:92~96℃预变性3~7min;92~96℃变性20~40s,58~62℃退火20~40s,70~74℃延伸20~40s,共32~36个循环;70~74℃延伸8~12min。

    8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,若扩增到316bp的条带,则待测样本中含有牛羊肠道小rna病毒;若未扩增到316bp的条带,则待测样本中不含有牛羊肠道小rna病毒。


    技术总结
    本发明涉及动物病毒学及分子生物学技术领域,尤其涉及一种用于检测牛羊肠道小RNA病毒的引物对及其应用。本发明提供了一种用于检测牛羊肠道小RNA病毒的引物对,所述引物对包括上游引物和下游引物;所述上游引物的序列如SEQ ID NO:1所示;所述下游引物的序列如SEQ ID NO:2所示,还提供了非诊断目的的检测牛羊肠道小RNA病毒的方法。该检测方法特异性强、灵敏度高、稳定性好,在时间成本、工作量等方面具有明显的优势,从核酸提取到琼脂糖凝胶电泳进行结果分析判定,可在3h内完成,耗时少、且成本低廉,解决了牛羊肠道小RNA病毒无法分离鉴定的问题。

    技术研发人员:钟舒红,李军,吴翠兰,冯世文,贺会利,彭昊,胡帅,禤雄标
    受保护的技术使用者:广西壮族自治区兽医研究所
    技术研发日:
    技术公布日:2024/11/26
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