一种与新疆多浪羊品种相关的SNP标记及其在鉴定新疆多浪羊品种中的应用

    专利查询2026-02-14  21


    本发明涉及动物品种鉴定,尤其涉及一种与新疆多浪羊品种相关的snp标记及其在鉴定新疆多浪羊品种中的应用。


    背景技术:

    1、多浪羊作为新疆的特色绵羊品种,属肉脂兼用粗毛型绵羊地方品种,多浪羊的中心产区位于喀什地区的麦盖提县,因此也叫“麦盖提大尾羊”。其种群数量大、个体生产性能优于南疆其他地方品种,并推广到南疆各地,是我区农区庭院养殖优势绵羊品种,具有持续发展和做大做强的优势条件。

    2、但是如何确定现有的个体是多浪羊品种是目前需要解决的技术问题。而品种鉴定技术是对畜禽品种的资源保护起着至关重要的作用,为研究羊遗传多样性奠定基础,更能为打击不法分子提供有力的科学依据。

    3、目前羊的芯片有很多商业化的,但是对新疆绵羊的适用性较低,也不具有品种鉴定的功能,因此筛选多浪羊的特异snp位点,这为多浪羊分子身份的鉴别具有重要的意义。


    技术实现思路

    1、本发明的目的在于提供一种与新疆多浪羊品种相关的snp标记及其在鉴定新疆多浪羊品种中的应用。

    2、为了实现上述发明目的,本发明提供以下技术方案:

    3、本发明提供了一种与新疆多浪羊品种性状相关的snp标记,所述与新疆多浪羊品种性状相关的snp标记包括250个位点。

    4、作为优选,所述新疆多浪羊品种性状包括毛色、脂质生物合成、胸围、产羔数、子宫内膜炎、体重。

    5、本发明提供了所述与新疆多浪羊品种性状相关的snp标记在鉴定新疆多浪羊品种中的应用。

    6、本发明还提供了检测所述与新疆多浪羊品种相关的snp标记的试剂在制备辅助鉴定新疆多浪羊品种的试剂中的应用。

    7、通过采用上述技术方案,本发明具有如下有益效果:

    8、本发明技术方案中通过对样本基因组测序后,采用bwa+gatk方法进行遗传变异检测获得原始的snp数据集,然后结合本发明中“最小平均深度为5,最大平均深度为20,至少包含2个等位基因,最多包含2个等位基因,最大缺失数据比例为30%,最小深度为5,最小质量值为20,最小基因型质量值为20”以及“最小次要等位基因频率为0.2,连锁不平衡r2阈值为0.6”的筛选标准,通过vcftools以及plink对snp数据集进行深度质控,最终得到与新疆多浪羊品种性状相关的250个snp位点。本发明筛选出的新疆多浪羊品种性状相关的snp位点特异性强,在其他品种中不存在;且该相应的snp位点具有连锁不平衡现象,与邻近的snp位点在种群中以固定的组合方式遗传。



    技术特征:

    1.一种与新疆多浪羊品种性状相关的snp标记,其特征在于,所述与新疆多浪羊品种性状相关的snp标记包括250个位点,各位点的位置如下:

    2.根据权利要求1所述的snp标记,其特征在于,所述新疆多浪羊品种性状包括毛色、脂质生物合成、胸围、产羔数、子宫内膜炎、体重。

    3.权利要求1或2所述与新疆多浪羊品种性状相关的snp标记在鉴定新疆多浪羊品种中的应用。

    4.检测权利要求1或2所述与新疆多浪羊品种相关的snp标记的试剂在制备辅助鉴定新疆多浪羊品种的试剂中的应用。


    技术总结
    本发明涉及动物品种鉴定技术领域。本发明提供了一种与新疆多浪羊品种性状相关的SNP标记,所述SNP标记与毛色、脂质生物合成、胸围、产羔数、子宫内膜炎、体重等品种性状相关。本发明还提供了所述与新疆多浪羊品种性状相关的SNP标记在鉴定新疆多浪羊品种中的应用。

    技术研发人员:刘武军,刘玲玲,方超,曹行,陈秋明,缑帅帅
    受保护的技术使用者:新疆农业大学
    技术研发日:
    技术公布日:2024/11/26
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