本发明涉及基因芯片，尤其是涉及一种湖南大围子猪snp分子标记及其应用。
背景技术：
1、湖南大围子猪是国家级畜禽遗传资源保护品种，为肉脂兼用型猪种，具有繁殖力强、母性好，耐粗饲，早熟易肥，肉质细嫩，杂交配合力强等优点，是生猪遗传资源库中宝贵的资源，蕴含着优良的种质基因。但湖南大围子猪的基础研究起步较晚，主要以常规选育和保种为主，对群体还未开展过系统性的分子遗传学研究，因此，亟需开发一款湖南大围子猪的液相芯片产品。
技术实现思路
1、本发明旨在至少解决现有技术中存在的技术问题之一。为此，本发明提出一种湖南大围子猪snp分子标记。
2、本发明还提出了一种具有用于检测上述湖南大围子猪snp分子标记的引物组和/或液相探针的湖南大围子猪液相芯片。
3、本发明还提出了一种具有用于检测上述湖南大围子猪snp分子标记的引物组和/或液相探针的试剂盒。
4、本发明还提出一种上述湖南大围子猪snp分子标记组合、引物组和/或探针、湖南大围子猪液相芯片或试剂盒的应用。
5、本发明还提出一种湖南大围子猪的育种方法。
6、根据本发明的一个方面，提出了一种湖南大围子猪snp分子标记，包括473个snp分子标记中的至少一种，所述473个snp分子标记的基因组位置是基于猪的参考基因组sscrofa11.1进行序列比对确定的，位点信息具体如下：
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11、在本发明的一些实施方式中，所述snp位点的位置信息采用染色体编号_物理位置的形式进行表示。
12、在本发明的一些实施方式中，所述473个snp分子标记如snp001-473所示；snp001-473的具体位点信息如上表从上至下，从左至右依次排序。
13、在本发明的第二方面，提出了一种湖南大围子猪液相芯片，所述液相芯片包括用于检测上述的湖南大围子猪snp分子标记的引物组和/或液相探针。
14、在本发明的第三方面，提出了一种试剂盒，所述试剂盒包含用于检测湖南大围子猪snp分子标记的引物组和/或液相探针。
15、在本发明的一些实施方式中，所述试剂盒还包括pcr反应试剂、核酸提取试剂中的至少一种。
16、在本发明的第四方面，提出了上述湖南大围子猪snp分子标记、试剂盒或湖南大围子猪液相芯片的应用，所述应用为在湖南大围子猪基因分型中的应用。
17、在本发明的一些实施方式中，所述应用为在湖南大围子猪全基因组关联分析中的应用。
18、在本发明的一些实施方式中，所述应用为在湖南大围子猪聚类分析中的应用。
19、在本发明的一些实施方式中，所述应用为在湖南大围子猪亲缘关系鉴定中的应用。
20、在本发明的一些实施方式中，所述应用为在湖南大围子猪育种或辅助育种中的应用。
21、在本发明的一些实施方式中，所述应用为在湖南大围子猪遗传图谱构建中的应用。
22、在本发明的一些实施方式中，所述应用为在湖南大围子猪种质资源鉴定中的应用。
23、一种湖南大围子猪育种方法，包括如下步骤：利用上述湖南大围子猪snp分子标记、试剂盒或湖南大围子猪液相芯片对待测样本dna进行检测，选择湖南大围子猪进行后续育种。
24、在本发明的一些实施方式中，所述检测基于液相探针捕获测序分型技术进行。
25、本发明至少具有以下有益效果：
26、本发明的snp分子标记可用于特异性鉴定湖南大围子猪，可以实现湖南大围子猪的品种鉴定、种质资源和亲缘关系鉴定和分析、种猪资源的保护和开发等，在湖南大围子猪育种的多个领域具有较高的应用价值。
27、本发明的其它特征和优点将在随后的说明书中阐述，并且，部分地从说明书中变得显而易见，或者通过实施本发明而了解。
1.一种湖南大围子猪snp分子标记，其特征在于，包括473个snp分子标记中的至少一种，所述473个snp分子标记的基因组位置是基于猪的参考基因组sscrofa11.1进行序列比对确定的，位点信息具体如下：
2.一种湖南大围子猪液相芯片，其特征在于，所述湖南大围子猪液相芯片包括用于检测权利要求1所述的湖南大围子猪snp分子标记的引物组和/或液相探针。
3.一种试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括用于检测权利要求1所述的湖南大围子猪snp分子标记的引物组和/或液相探针。
4.权利要求1所述的湖南大围子猪snp分子标记、权利要求2所述的湖南大围子猪液相芯片和权利要求3所述的试剂盒中的至少一种在湖南大围子猪基因分型中的应用。
5.权利要求1所述的大围子猪snp分子标记、权利要求2所述的湖南大围子猪液相芯片和权利要求3所述的试剂盒中的至少一种在湖南大围子猪全基因组关联分析中的应用。
6.权利要求1所述的湖南大围子猪snp分子标记、权利要求2所述的湖南大围子猪液相芯片和权利要求3所述的试剂盒中的至少一种在湖南大围子猪聚类分析中的应用。
7.权利要求1所述的湖南大围子猪snp分子标记、权利要求2所述的湖南大围子猪液相芯片和权利要求3所述的试剂盒中的至少一种在湖南大围子猪亲缘关系鉴定中的应用。
8.权利要求1所述的湖南大围子猪snp分子标记、权利要求2所述的湖南大围子猪液相芯片和权利要求3所述的试剂盒中的至少一种在湖南大围子猪育种或辅助育种中的应用。
9.权利要求1所述的湖南大围子猪snp分子标记、权利要求2所述的湖南大围子猪液相芯片和权利要求3所述的试剂盒中的至少一种在湖南大围子猪遗传图谱构建或种质资源鉴定中的应用。
10.一种湖南大围子猪的育种方法，其特征在于，包括如下步骤：利用权利要求2所述的湖南大围子猪液相芯片或权利要求3所述的试剂盒对待测样本dna进行检测，选择湖南大围子猪进行后续育种。
